Scedosporiosis pulmonar post COVID-19 en paciente diabético: a propósito de un caso

Las especies de Scedosporium son consideradas patógenos oportunistas emergentes, que afectan a pacientes inmunocomprometidos o con respuesta inmunológica normal. La enfermedad invasiva grave supera tasas de mortalidad del 80 %. Se describe caso con afectación pulmonar causada por el complejo de especies de Scedosporium en un paciente masculino de 75 años de edad, procedente de Caracas, Venezuela, con diabetes mellitus tipo 2, infección respiratoria baja, dos infecciones previas por enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19) e imagen radiológica de lesión de ocupación de espacio pulmonar basal izquierdo. Se envió al laboratorio de microbiología porción de aproximadamente 1 cm2 de tejido pulmonar, solicitando estudios micológicos y para micobacterias. Al examen directo con KOH al 20 % se observó un fragmento de hifa hialina tabicada. A los 12 días de incubación hubo crecimiento en agar Sabouraud dextrosa más gentamicina de colonias vellosas con pigmentado difusible color amarillo pálido a mostaza. Se realizó examen directo a las colonias con azul de algodón, observándose estructuras compatibles con el complejo de especies de Scedosporium. Scedosporium spp., es el segundo hongo filamentoso, después de Aspergillus spp., causante de infecciones respiratorias bajas. El paciente fue tratado con voriconazol después del diagnóstico micológico con una evolución satisfactoria. Las infecciones por especies de Scedosporium afectan órganos internos como los pulmones, similar al caso descrito. La infección por COVID-19 es un factor predisponente para adquirir infecciones fúngicas poco frecuentes. El laboratorio de microbiología cumple un rol importante en el diagnóstico de micosis causadas por hongos inusuales.

Scedosporium species are considered emerging opportunistic pathogens affecting immunocompromised patients or patients with normal immune response. Mortality rates exceed 80 % in severe invasive disease. We describe a case of lung involvement caused by Scedosporium species complex in a 75-year-old male patient from Caracas, Venezuela, with type 2 diabetes mellitus, lower respiratory tract infection, two previous coronavirus disease infections 2019 (COVID-19) and radiological findings of a left basal lung space-occupying lesion. A piece of lung tissue measuring approximately one cm2 was sent to the microbiology laboratory, requesting mycology and mycobacteria studies. Direct examination with 20 % KOH revealed a hyaline septate hyphal fragment. Growth of hairy colonies with diffusible pale yellow to mustard pigment was observed on Sabouraud dextrose plus gentamicin agar after 12 days of incubation. Structures compatible with the Scedosporium species complex were observed on direct examination of the colonies with cotton blue. Scedosporium spp. is the second most common filamentous fungus causing infections of the lower respiratory tract after Aspergillus spp. The patient was treated with voriconazole after mycological diagnosis with satisfactory outcome. Infections with Scedosporium spp. affect internal organs such as the lungs, similar to the case described. COVID-19 infection predisposes to the acquisition of uncommon fungal infections. The microbiology laboratory plays an important role in the diagnosis of mycoses caused by unusual fungi.

Prueba Xpert® MTB/RIF para el diagnóstico de Tuberculosis en el Instituto Médico La Floresta

La necesidad de un diagnóstico rápido, sensible y específico para tuberculosis es apremiante; se estiman 4 000 muertes cada día y aproximadamente 28 000 personas se contagian de esta enfermedad. La prueba Xpert®MTB/RIF consiste en un ensayo de diagnóstico in vitro de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) en tiempo real automatizada, semicuantitativa, que en tan solo dos horas, permite detectar el ácido desoxirribonucleico (ADN) del complejo Mycobacterium tuberculosis (MTB) y mutaciones asociadas a la resistencia a rifampicina. Objetivo: Describir la experiencia del ensayo Xpert®MTB/ RIF y su valor diagnóstico en Dpto. de Microbiología del Instituto Médico La Floresta, desde abril 2012 hasta abril 2021. Métodos: Estudio descriptivo de muestras respiratorias y de otras procedencias, de pacientes con sospecha de tuberculosis, ensayadas por PCR a través del Xpert®MTB/RIF. Adicionalmente se realizó Ziehl-Neelsen y cultivo por el método de Ogawa Kudoh modificado, dependiendo del volumen de muestra recibida. Resultados: De 618 PCR realizadas, 58 muestras fueron positivas (9,4 %), 56 correspondieron a adultos y 2 a niños, 81 % se clasificaron como tuberculosis pulmonar y 19 % como extrapulmonar. A 37 se les realizó cultivo, de las cuales 10 no desarrollaron crecimiento, y a 33 adicionalmente Ziehl-Neelsen, de las cuales 12 presentaron baciloscopias negativas. En cinco de las muestras se detectó resistencia a rifampicina. Conclusiones: A través de la prueba Xpert®MTB/RIF fue posible detectar MTB en aquellas con baciloscopias negativas, en las que no desarrollaron crecimiento en el cultivo y permitió la rápida instauración de tratamiento en la tuberculosis multirresistente.

The rapid, sensitive, and specific diagnosis for tuberculosis is urgent; 4 000 deaths are estimated every day and approximately 28 000 people are infected with this disease. The Xpert®MTB/RIF test consists of an automated, semi-quantitative real-time polymerase chain reaction (PCR) in vitro diagnostic assay that, in just two hours, allows the detection of Mycobacterium tuberculosis complex (MTB) DNA and mutations associated with resistance to rifampicin. Objective: To describe the experience of the Xpert®MTB/RIF assay and its diagnostic value in the Department of Microbiology of the La Floresta Medical Institute, from April 2012 to April 2021. Methods: Descriptive study of respiratory samples and other sources, from patients with suspected of tuberculosis, assayed by PCR through Xpert®MTB/RIF. Additionally, Ziehl-Neelsen and culture were performed by the modified Ogawa Kudoh method, depending on the volume of sample received. Results: Of 618 PCR performed, 58 samples were positive (9.4 %), 56 corresponded to adults and 2 to children, 81 % were classified as pulmonary tuberculosis and 19 % as extrapulmonary. Culture was performed on 37, of which 10 did not develop growth, and on 33 additionally Ziehl-Neelsen, of which 12 presented negative bacilloscopy. Rifampicin resistance was detected in five of the samples. Conclusions: Through the Xpert®MTB/RIF test, it was possible to detect MTB in those with negative bacilloscopy, in which they did not develop growth in the culture and allowed the rapid establishment of treatment in multidrug-resistant tuberculosis.